CRISPR-Cas13
CRISPR-Cas13 também conhecido como CRISPR-Cas Tipo VI, RNA-alvo CRISPR-Cas13a e anteriormente conhecido como C2c2 é uma tecnologia de edição de ácido nucleico, particularmente no nível de RNA, análoga ao sistema CRISPR/Cas9.[1] O sistema CRISPR-Cas Tipo VI contêm o programável efetor único guiado RNA com RNases Cas13[2] e pode ser manipulado para derrubar (knockdown)[3] e ligar (binding) ARN de células de mamíferos. CRISPR-Cas13 pode ser usado como uma plataforma flexível para estudar RNA em células de mamíferos e para o desenvolvimento terapêutico.[4] Cas-13 foi descoberto pela primeira vez em L. shahii, uma espécie da bactéria Leptotrichia, enquanto os pesquisadores procuravam sistemas CRISPR não identificados anteriormente.[5]
Este artigo faz parte de uma série sobre CRISPR | |
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O CRISPR-Cas13 pode trabalhar com vírus para fins explícitos de pesquisa, como investigação de ciclos virais. A possível utilização no cenário clínico exigirá o desenvolvimento de uma estratégia de entrega e estudos com animais. O CRISPR-Cas13 pode atingir mais de 350 dos 396 vírus ssRNA conhecidos associados a seres humanos. Duas variantes da proteína, LwaCas13a (de Leptotrichia wadeii) e PspCas13b (de Prevotella sp. P5-125), têm atividade antiviral significativa. O CRISPR-Cas13 pode trabalhar com vírus para fins explícitos de pesquisa, como investigação de ciclos virais.[6]
Platafomas para diagnóstico
editarA nuclease Cas13 foi a inovação que levou ao desenvolvimento da ferramenta de diagnóstico, denominada SHERLOCK (Specific Enzymatic Reporter UnLOCKing),[7] que utiliza fios de RNA sintético para criar um sinal após o corte. O Cas13 cortará esse RNA depois de cortar seu alvo original, liberando a molécula de sinalização.[6] O resultado final é uma leitura que informa ao usuário se o destino inicial ainda está presente. SHELOCK está trabalhando com o Cas14, bem como o Cas12 e o Cas13, em sua plataforma de diagnóstico.[8]
CARVER (restrição de expressão e leitura viral assistida por Cas13), um sistema que utiliza a enzima CRISPR Cas13, que “direciona naturalmente o RNA viral a bactérias. A propriedade dessa plataforma permitiu que os pesquisadores detectassem e destruíssem com êxito três vírus de RNA: vírus influenza A, vírus de coriomeningite linfocítica e vírus de estomatite vesicular.[6][9]
COVID-19
editarEm maio de 2020, o FDA concedeu uma autorização de emergência para um teste baseado no CRISPR que pode diagnosticar o COVID-19 em cerca de uma hora. O teste usa a enzima Cas13a para identificar uma sequência de RNA exclusiva da SARS-CoV-2.[10] O teste rápido foi projetado para fornecer um resultado COVID-19 em cerca de uma hora, sem equipamento de laboratório especializado.[11]
Referências
- ↑ «RNA editing with CRISPR-Cas13»por David B. T. Cox et al, publicado em "Science - em 25 de outubro de 2017:eaaq0180 (DOI: 10.1126/science.aaq0180)
- ↑ «Cas13b is a Type VI-B CRISPR-associated RNA-Guided RNase differentially regulated by accessory proteins Csx27 and Csx28»por Aaron Smargon et al, publicado por "Molecular Cell" doi: 10.1016/j.molcel.2016.12.023 (2017)
- ↑ Summerton, J (1999). «Morpholino Antisense Oligomers: The Case for an RNase-H Independent Structural Type». Biochimica et Biophysica Acta. 1489 (1): 141–58. PMID 10807004. doi:10.1016/S0167-4781(99)00150-5
- ↑ «RNA targeting with CRISPR–Cas13»por Omar O. Abudayyeh et al, publicado em "Nature (2017) doi:10.1038/nature24049
- ↑ He, Meredith Hanel,Jude Gomila,Carla Faraguna,Michael Mangus,Sumon Sadhu,Tianchang. «CRISPR-Cas13 - Wiki». Golden (em inglês). Consultado em 11 de junho de 2020
- ↑ a b c «CRISPR-Cas13 can fight off our viruses». Genome Context (em inglês). 11 de outubro de 2019. Consultado em 14 de outubro de 2019
- ↑ «Synthego | Full Stack Genome Engineering». www.synthego.com (em inglês). Consultado em 16 de outubro de 2019
- ↑ «CRISPR diagnostic maker Sherlock Biosciences says the game's afoot with $35M launch». FierceBiotech (em inglês). Consultado em 16 de outubro de 2019
- ↑ «Broad Institute Researchers Develop CRISPR-Based Diagnostic, Antiviral Platform». GenomeWeb (em inglês). Consultado em 14 de outubro de 2019
- ↑ «Stanford team deploys CRISPR gene editing to fight COVID-19». FierceBiotech (em inglês). Consultado em 11 de junho de 2020
- ↑ «Sherlock Bio links with Danaher's IDT to supply its CRISPR-based coronavirus test». FierceBiotech (em inglês). Consultado em 11 de junho de 2020